Un nouvel antibiotique tue les superbactéries de façon inhabituelle
Un nouvel antibiotique potentiel est très efficace contre les «superbactéries» telles que le SARM qui sont résistantes à de nombreux antibiotiques, et tue les bactéries d’une manière inhabituelle, ce qui signifie qu’il sera extrêmement difficile pour la résistance d’évoluer.
Un nouvel antibiotique appelé clovibactine
L’antibiotique, la clovibactine, a été découvert dans une bactérie rare isolée d’un sol sablonneux collecté en Caroline du Nord. Markus Weingarth de l’Université d’Utrecht aux Pays-Bas et ses collègues ont étudié son fonctionnement, avec des résultats prometteurs. « L’activité est encore meilleure que pour l’étalon-or, la vancomycine », dit-il.
La résistance aux antibiotiques est un problème majeur et croissant dans le monde. On estime qu’il a tué 1,3 million de personnes en 2019 – plus que le paludisme et le sida réunis – et a contribué à la mort de près de 4 millions de personnes supplémentaires.
Cela signifie qu’il y a un besoin désespéré de nouveaux médicaments, capables de tuer les bactéries résistantes aux anciens antibiotiques et, idéalement, de les tuer d’une nouvelle manière, de sorte qu’il est plus difficile pour la résistance d’évoluer et de se propager.
Cet antibiotique tue plusieurs bactéries de façon inhabituelle
La clovibactine répond au premier critère, puisque l’équipe a découvert qu’elle tue une série de bactéries pathogènes, notamment le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline, mieux connu sous le nom de superbactérie SARM, et le Mycobacterium tuberculosis, responsable de la tuberculose. Plus important encore, Weingarth et ses collègues ont également découvert qu’il agit d’une manière différente de tout autre antibiotique.
De nombreux antibiotiques ciblent la paroi cellulaire des bactéries, une structure rigide en forme de filet qui entoure la membrane cellulaire. Si cette paroi est détruite, les cellules éclatent et meurent. Il s’agit d’une bonne cible car cette paroi n’existe pas dans les cellules animales, ce qui signifie que ces antibiotiques ne tuent que les cellules bactériennes. Mais les antibiotiques actuels ciblent généralement les enzymes protéiques qui assemblent la paroi cellulaire, et les bactéries peuvent modifier la forme de ces enzymes pour échapper à l’attaque.
Elle cible un groupe chimique appelé pyrophosphate
La clovibactine cible plutôt un groupe chimique appelé pyrophosphate qui se trouve non seulement sur un, mais sur trois blocs de construction différents des parois cellulaires. Ainsi, pour survivre, une bactérie devrait modifier ces trois éléments constitutifs. « Plus vous avez de cibles, plus il est difficile pour une bactérie de développer une résistance », explique Weingarth. De plus, toute modification de ces composants empêcherait presque certainement la paroi cellulaire de se former correctement.
L’équipe a exposé des bactéries à de faibles doses de clovibactine pour voir si une résistance émergeait, mais n’en a trouvé aucune. « Bien que nous ayons essayé très fort, il n’y avait aucune résistance détectable », dit-il. Des doses plus faibles sont plus susceptibles d’entraîner une résistance car elles exposent les bactéries à un antibiotique sans les tuer, et celles qui acquièrent une résistance surpasseront rapidement les autres.
Une résistance est peu probable
Cela ne signifie pas que la résistance à la clovibactine est impossible. Par exemple, de nombreuses bactéries sont classées comme à Gram négatif, ce qui signifie qu’elles possèdent une membrane supplémentaire à l’extérieur de la paroi cellulaire qui les protège de certains antibiotiques, dont la clovibactine. Les bactéries à Gram-positif, qui ne possèdent pas cette paroi, pourraient en théorie développer une barrière similaire pour empêcher la clovibactine d’atteindre leur paroi cellulaire, mais il s’agit d’un changement structurel majeur qui est très improbable, explique M. Weingarth.
« La clovibactine est une excellente piste pour le développement d’une nouvelle classe d’antibiotiques », déclare Gerry Wright, de l’université McMaster au Canada, qui ne fait pas partie de l’équipe. « Cela fait plus de 20 ans que nous n’avons pas approuvé une nouvelle classe de médicaments anti-Gram positif.
« Alors que le besoin de nouveaux antibiotiques ciblant les bactéries à Gram négatif suscite de vives inquiétudes, nous disposons de relativement peu d’antibiotiques alternatifs efficaces pour les infections à Gram positif », ajoute M. Wright. « Il y a une résistance croissante à tous les médicaments disponibles, et les bactéries telles que le staphylocoque doré sont parmi les sources les plus courantes d’infections bactériennes dans les établissements de santé et en dehors. »
Aucun effet indésirable
Lors de tests effectués sur des souris, la clovibactine n’a pas semblé avoir d’effets indésirables, et elle est actuellement développée par une société américaine, NovoBiotic Pharmaceuticals. « De la souris à l’homme, il y a un très long chemin à parcourir », précise M. Weingarth. « Je ne veux pas en faire trop.
Cette recherche a été publiée dans bioRxiv.
Source : New Scientist
Crédit photo : Depositphotos