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Un anticorps qui cible Omicron et tous les variants du SARS-CoV-2

biologie 08 avril 2023

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Une équipe dirigée par des chercheurs de Weill Cornell Medicine, de l’Université du Wisconsin-Madison; Scripps Research et de l’Université de Chicago a identifié un anticorps qui semble bloquer l’infection par tous les variants dominants du virus qui cause le COVID-19, y compris Omicron, le plus. Leur découverte pourrait conduire à des vaccins plus puissants et à de nouveaux traitements à base d’anticorps.

Un anticorps qui cible tous les variants

Dans une étude le Dr Patrick Wilson, professeur de recherche pédiatrique Anne E. Dyson et membre de l’Institut Gale et Ira Drukier pour la santé des enfants de Weill Cornell Medicine, et ses collègues ont testé des anticorps dérivés d’échantillons de sang de patients, contre des versions successives du virus apparues pendant la pandémie. L’une de ces protéines, baptisée S728-1157, s’est avérée très efficace pour neutraliser non seulement les variants plus anciens, mais également sept sous-types d’Omicron.

“La pandémie se termine, mais le virus est là pour le long terme. S’il n’est pas bien contrôlé, il pourrait provoquer des épidémies annuelles”, a déclaré le Dr Wilson. « Cet anticorps et les informations qu’il fournit pourraient nous aider à supprimer les poussées annuelles de la COVID-19 ou s’il y a une autre pandémie de coronavirus.”

Au fur et à mesure qu’il se réplique dans les cellules de ceux qu’il infecte, le virus SARS-CoV-2, acquiert de nouvelles mutations. Ces changements sont la matière première des nouveaux variants, dont certains ont la capacité d’échapper partiellement aux vaccins et aux traitements à base d’anticorps développés pour lutter contre le virus d’origine.

Le variant XBB.1,5 prédominait aux États-Unis

Bien que de nombreux variants soient apparus, seuls certains ont le potentiel, d’avoir un impact significatif sur les infections à l’échelle mondiale. Il s’agit notamment d’Omicron, qui est apparu pour la première fois en novembre 2021. À la mi-mars, l’un de ses sous-types, connu sous le nom de XBB.1,5, a prédominé aux États-Unis.

Au début de la pandémie, avant l’apparition des variantes, la Dre Maria Lucia Madariaga, professeure adjointe de chirurgie à l’Université de Chicago, a prélevé des échantillons de sang sur des personnes qui se remettaient de la COVID-19. Dans le cadre de la réponse au virus, le système immunitaire génère des protéines appelées anticorps qui s’accrochent à des parties spécifiques du virus, bloquant sa capacité à infecter une cellule et maltraitant le système immunitaire pour le détruire.

Le groupe du Dr Wilson a analysé les cellules productrices d’anticorps à partir de ces échantillons pour trouver celles qui se sont accrochées à la protéine S du virus, qu’il utilise pour pénétrer dans les cellules humaines. Le co-premier auteur, le Dr Siriruk Changrob, instructeur d’immunologie en pédiatrie dans son laboratoire, a testé les anticorps qu’ils ont trouvés contre 12 variants du SARS-CoV-2, y compris la version originale du virus.

Un anticorps, appelé S728-1157, s’est distingué par sa capacité à interférer avec Omicron. Dans des expériences avec des hamsters, leurs collègues de l’École de médecine vétérinaire de l’Université du Wisconsin-Madison, ont découvert qu’un traitement avec cet anticorps réduisait, ou supprimait, la quantité de virus d’origine, ainsi que les variants Delta et Omicron dans le nez et les poumons des animaux. (Ils le testent actuellement contre XBB.1.5.) D’autres collaborateurs de Scripps Research ont analysé la structure de cet anticorps lié au pic pour comprendre où il se liait, et pourquoi les mutations d’Omicron n’interféraient pas.

S728-1157 serait une alternative aux traitements à base d’anticorps

Leurs résultats suggèrent que le S728-1157 pourrait devenir la base d’une alternative indispensable aux traitements conventionnels à base d’anticorps. L’arrivée de variants, en particulier Omicron, a rendu nombre de ces thérapies, appelées anticorps monoclonaux, inefficaces.

Cette recherche pourrait également guider la conception de nouveaux vaccins qui reposent sur la protéine S pour stimuler la production d’anticorps. L’équipe a découvert que la configuration de S importait. Plus précisément, le système immunitaire produit des anticorps plus largement efficaces comme S728-1157 lorsqu’il rencontre des pics dans une conformation ouverte, comme celle qu’ils supposeraient attaquer une cellule. Les vaccins actuels à base d’ARNm, en particulier à base d’Omicron, ont cependant tendance à produire des pics plus fermés.

Cette recherche a été publiée dans le Journal of Clinical Investigation.

Source : Weill Cornell Medicine
Crédit photo : Pexels