Votre enfance façonne le mélange de virus dans votre intestin
Avoir des frères et sœurs plus âgés, peut influencer le mélange de virus dans les intestins des bébés, connu sous le nom de virome intestinal. Bien qu’il y ait eu de nombreuses recherches sur la façon dont les bactéries intestinales influencent notre santé, nous en savons beaucoup moins sur l’importance des virus dans l’intestin, qui peuvent avoir de bons et de mauvais effets.
Les bactériophages des bébés
À la naissance, les intestins de la plupart des bébés sont dépourvus de virus, mais au cours des premières années de leur vie, les virus qui infectent directement les cellules intestinales et ceux qui infectent les bactéries intestinales – appelées bactériophages – commencent à coloniser les intestins. Ces virus pénètrent dans l’intestin avec la nourriture ou sont ingérés lorsque les bébés interagissent avec d’autres personnes et leur environnement.
Pour mieux comprendre les premières influences sur les viromes intestinaux des enfants, Ling Deng et Jakob Stokholm, tous deux de l’Université de Copenhague, et leurs collègues ont analysé des échantillons fécaux de 645 nourrissons âgés d’un an vivant à Copenhague, collectés dans le cadre d’une précédente étude sur l’asthme.
Plus de 16 000 espèces virales différentes
Pour ce faire, ils ont filtré les virus des échantillons de selles avant de séquencer les génomes d’ADN des virus, révélant plus de 16 000 espèces virales différentes dans les intestins des bébés, dont plus de 90 % étaient des bactériophages. Les chercheurs ont ensuite comparé la composition des viromes intestinaux des nourrissons avec une gamme de facteurs environnementaux auxquels les bébés avaient été exposés, selon les réponses à l’enquête.
Ils ont découvert que le fait d’avoir des frères et sœurs plus âgés, était lié à une diversité accrue des virus dans les intestins des bébés et à une plus grande variation de l’abondance des différents virus intestinaux.
Les bébés qui vivaient dans une zone rurale plutôt qu’urbaine, avaient une plus grande abondance de virus qui infectent certaines bactéries, comme celles trouvées dans le yaourt, mais la raison de ce lien n’est pas claire, dit Stokholm. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour établir exactement comment les changements dans le virome peuvent influencer la santé des personnes pendant leur enfance et plus tard dans la vie.
« Il a été proposé pendant de nombreuses années qu’il est bon d’avoir une grande diversité de bactéries intestinales, mais avec les virus intestinaux, c’est une terre totalement nouvelle, il est donc difficile de dire s’il est bon ou mauvais d’avoir une plus grande diversité ou une distribution plus uniforme de différentes espèces virales », explique Stokholm.
Le virome pourrait influencer la santé future
Comme le virome infantile prépare le terrain pour le virome adulte, il peut influencer notre santé future, dit Lori Holtz de l’Université de Washington à St. Louis, Missouri. À l’avenir, la modification de l’exposition des nourrissons aux facteurs environnementaux pourrait les aider à développer un virome optimal, explique Holtz.
Cependant, cette étude se concentre uniquement sur les virus avec un génome d’ADN, plutôt qu’un génome d’ARN, laissant beaucoup à découvrir, explique Holtz. De plus, les participants étaient principalement blancs, donc des recherches supplémentaires sur des populations plus diversifiées sont nécessaires, dit-elle.
Cette recherche a été publiée dans bioRxiv.
Source : New Scientist
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