Prédire la probabilité des naissances prématurées avec des prélèvements vaginaux
Certaines substances métaboliques présentes dans le vagin pourraient permettre de prédire si un bébé naîtra prématurément, ce qui est l’une des principales causes de décès des nouveau-nés. L’analyse du microbiome vaginal pendant la grossesse pourrait aider les prestataires de soins de santé à identifier et à gérer les grossesses à haut risque.
Prédire si un bébé naîtra prématurément
Tal Korem, de l’université Columbia de New York, et ses collègues ont évalué 232 échantillons d’écouvillons vaginaux prélevés au cours du deuxième trimestre de la grossesse, dont 80 provenaient de grossesses se terminant par une naissance prématurée. Environ 75 % des échantillons provenaient de personnes s’identifiant comme noires, un groupe touché de manière disproportionnée par les naissances prématurées aux États-Unis.
L’équipe a utilisé ces données pour entraîner des modèles d’apprentissage automatique afin de prédire si une grossesse se terminerait par une naissance prématurée et a constaté que certains métabolites, mais pas les microbes, présentaient la plus forte association avec la naissance prématurée.
Une prédiction relativement bonne
Un modèle utilisant des données sur les métabolites et la race avait 78 % de chances d’identifier correctement si un échantillon provenait d’une femme dont la grossesse s’était terminée par une naissance prématurée ou non, alors qu’un modèle utilisant des données sur les microbes, la race et d’autres facteurs cliniques avait 59 % de chances.
Il est à noter qu’un grand nombre des métabolites associés aux naissances prématurées n’ont pas été créés par des microbes ou des humains, explique Korem. « Ils proviennent d’une source externe », précise-t-il. Bien que des analyses supplémentaires soient nécessaires pour identifier la source, certains de ces métabolites, comme l’éthyl glucoside et l’EDTA, sont présents dans certains produits cosmétiques et hygiéniques.
« C’est loin d’être une preuve », dit Korem, qui précise que ces résultats ne sont qu’une association et ne prouvent pas une relation de cause à effet. Par conséquent, aucune recommandation ne peut être faite pour éliminer certains produits. « C’est très préliminaire, mais nous levons en quelque sorte un drapeau et disons, regardez, il y a quelque chose de suspect ici que nous devons examiner », dit-il.
Ce modèle pourrait produire des résultats différents
« Cette étude, parce qu’elle se concentre vraiment sur le recrutement de femmes noires, a très bien réussi à surreprésenter les personnes sous-représentées », déclare Christine Metz, de l’Institut Feinstein de recherche médicale de New York.
Cependant, comme le microbiome peut changer en fonction de divers facteurs tels que les expositions environnementales, il est possible que ce modèle produise des résultats différents pour des échantillons prélevés sur la même personne à des jours différents, dit-elle.
Cette recherche a été publiée dans Nature Microbiology.
Source : New Scientist
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