La COVID-19 grave est lié à plus de 1300 variantes génétiques
Plus de 1 000 gènes peuvent contribuer au risque de développer une forme grave de la maladie de Creutzfeldt-Jakob, en plus des circonstances de la vie telles que l’âge, l’origine ethnique et les problèmes de santé. La plupart de ces gènes, découverts lors d’une étude portant sur plus d’un million de personnes, affectent le fonctionnement de deux types de cellules immunitaires.
Un éventuel test pour la COVID-19 grave
Si ces résultats sont confirmés, ils pourraient servir de base à un test permettant d’évaluer le risque qu’une personne soit gravement atteinte de la COVID-19, explique Johnathan Cooper-Knock de l’université de Sheffield, au Royaume-Uni.
« Nous savons que certains jeunes gens, par ailleurs en bonne santé, sont gravement atteints par la COVID-19 », explique-t-il. « Nous essayons d’identifier les déterminants génétiques qui exposent les gens au risque, indépendamment des facteurs plus évidents. » L’équipe de Cooper-Knock a utilisé l’intelligence artificielle pour analyser les résultats d’un ensemble de données mondiales appelé « COVID-19 Host Genetics Initiative », un projet de génétique géré par un groupe de chercheurs et d’entreprises.
Une vaste étude des variantes génétiques
L’équipe a examiné les variantes génétiques les plus fréquentes chez environ 5 100 personnes qui sont décédées ou ont eu besoin d’une assistance respiratoire à cause de la COVID-19, par rapport à environ 1,4 million de personnes qui n’ont jamais été testées positives. Aucun des participants n’avait été vacciné contre la COVID-19.
Le groupe de recherche a trouvé 1 370 variantes génétiques liées à la gravité de l’infection par la COVID-19, et ces mêmes variantes sont réapparues lorsqu’elles ont été comparées à deux ensembles de données similaires. Ces variantes représentaient les trois quarts du risque génétique de la COVID-19 sévère des participants, le quart restant du risque étant inconnu, selon l’équipe.
Ensuite, l’équipe a recoupé ces résultats avec des informations sur les gènes qui sont normalement actifs dans 19 types de cellules différentes dans des poumons sains. Il en ressort que les cellules immunitaires appelées cellules tueuses naturelles et cellules T jouent un rôle-clé dans le contrôle de la gravité de la COVID-19.
Un prototype devra être testé
Avant que ces résultats ne puissent être transformés en un test génétique commercial, un prototype doit être testé, explique Mme Cooper-Knock. « Nous séquencerions [les participants] avant qu’ils ne soient atteints de la COVID-19, nous les répartirions dans des groupes à risque et nous ferions des prédictions. »
Un tel test pourrait être moins précis s’il est utilisé sur des personnes vaccinées, car la susceptibilité génétique est moins pertinente si vous bénéficiez de la protection d’un vaccin, explique James Davies de l’Université d’Oxford.
Néanmoins, ces résultats mettent en lumière les mécanismes impliqués dans la COVID-19 sévère, ce qui pourrait conduire à de nouveaux traitements, dit-il. « La principale importance réside dans l’identification de nouvelles options thérapeutiques », ajoute-t-il.
Cette recherche a été publiée dans Cell Systems.
Source : New Scientist
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