Stocker de l'information avec des trous dans l'ADN
Certains des premiers ordinateurs utilisaient un système de mémoire à cartes perforées, stockant littéralement des informations sur des cartes perforées. Les chercheurs ont maintenant trouvé un moyen d’appliquer le même concept à l’ADN.
Utiliser de l’ADN pour stocker de l’information
Les séquences d’ADN ont souvent été suggérées comme une forme de stockage de données, mais de nombreuses méthodes pour le faire sont fastidieuses ou coûteuses, telles que la synthèse d’un nouvel ADN en laboratoire. Au lieu de cela, Olgica Milenkovic de l’Université de l’Illinois à Urbana-Champaign et ses collègues ont effectué de minuscules coupures dans des brins d’ADN d’E. Coli, les transformant en l’équivalent moléculaire des cartes perforées.
L’équipe a coupé ou partiellement coupé les brins d’ADN à des points particuliers toutes les 25 paires de bases le long de la séquence. Une coupure représente un « 1 » et l’absence de coupure représente un « 0 », ce qui crée un code binaire «perforé» dans de l’ADN, permettant de stocker toute forme de données numériques.
«Nous ne savions pas si nous pouvions placer des trous si proches les uns des autres», déclare Milenkovic. «C’était vraiment génial de voir que ça fonctionnait.» Malgré l’affaiblissement de l’ADN en le coupant, les molécules restaient soudées. Elles pourraient peut-être accroître la densité de stockage des informations dans un ordinateur quantique.
L’équipe a utilisé leurs cartes perforées d’ADN pour stocker le texte du discours de Gettysburg d’Abraham Lincoln et une photo du Lincoln Memorial à Washington DC. Les deux fichiers ont été extraits avec une « précision parfaite », explique Milenkovic, en séparant l’ADN et en séquençant les brins entaillés. La comparaison de ces séquences avec une référence du génome de E. coli révèle la position des trous et, par conséquent, le code binaire enregistré.
La synthèse d’un nouvel ADN n’est pas nécessaire
Milenkovic dit que l’utilisation de l’ADN extrait d’E. coli facilite le stockage et la lecture des données ultérieurement. L’utilisation de l’ADN d’origine naturelle pour le stockage offre une source infinie de possibilités, déclare Luis Ceze de l’Université de Washington. « Vous n’avez pas besoin de le synthétiser à partir de rien, c’est un plus pour faciliter le stockage de données. », dit-il.
Mais il ajoute que les étapes nécessaires pour cibler les bons morceaux d’ADN à cicatriser sont encore quelque peu laborieuses. Il sera peut-être possible de créer un outil pour automatiser ce processus dans les prochaines versions de ce système, dit-il.
Les résultats de cette recherche ont été publiés dans biorXiv.
Source : New Scientist
Crédit photo : Pixbay